本发明属于病毒检测,具体地,涉及一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒。
背景技术:
1、人类pegivirus-1(hpgv-1)是一种广泛流行的黄病毒科单链正向rna病毒,主要通过输血、注射吸毒、经皮损伤及性接触等途径传播。全球约1/6的人口呈现hpgv-1血清学阳性,其在不同国家和地区的流行率存在显著差异。hpgv-1感染在普通人群中的流行率为0.8%-44.6%,而在高危人群如注射吸毒者和男男性行为者中的感染率则更高,达到1.8%-75.3%。尽管hpgv-1通常被认为是一种不致病且可能有益的病毒,但其在与hiv-1共感染时能提高艾滋病人的生存率,这引发了对其在其他人类疾病中可能发挥的积极作用的关注。
2、目前,检测hpgv-1感染最常用的方法是rt-pcr,该方法通过逆转录hpgv-1 rna病毒为cdna,再以cdna为模板进行pcr扩增,扩增产物通过凝胶电泳即可判读结果。rt-pcr方法具有较高的准确性,能够检测hpgv-1病毒血症患者血清或血浆及体液中的hpgv-1-rna。然而,rt-pcr方法存在检测周期长、速度慢的问题,且需要复杂的实验设备和专业操作技能,限制了其在临床诊断和大规模筛查中的应用。
3、另一种检测方法是基于elisa技术的hpgv抗体检测,该方法通过固相抗原吸附剂捕获血清中的hpgv抗体进行判读。但是由于缺乏统一检测标准,不同检测体系造成了结果差异较大,无法进行横向比较,病毒拷贝数的阈值无法达成共识,给报告解读带来一定困扰。此外,elisa方法仅适用于检测hpgv抗体,无法直接检测病毒rna,因此在病毒血症期或早期感染阶段可能无法准确判断感染状态。
4、基于上述描述,需要开发一种能够快速、有效且准确检测hpgv-1病毒的方法。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,解决了背景技术中提出的问题。
2、本发明的目的可以通过以下技术方案实现:
3、一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,包括以下组分:反应液、样本处理液、hpgv-1病毒阴性对照和hpgv-1病毒阳性对照;
4、其中,反应液中包括恒温扩增体系和引物组。
5、进一步地,所述引物组为utr1引物组、utr2引物组、utr3引物组、utr4引物组和ns5引物组中的至少一种。
6、进一步地,所述utr1引物组包括序列如seq id no:1所示的f3,序列如seq id no:2所示的b3,序列如seq id no:3所示的fip,序列如seq id no:4所示的bip,序列如seq idno:5所示的lb;
7、utr2引物组包括序列如seq id no:6所示的f3,序列如seq id no:7所示的b3,序列如seq id no:8所示的fip,序列如seq id no:9所示的bip,序列如seq id no:10所示的lf,序列如seq id no:11所示的lb;
8、utr3引物组包括序列如seq id no:12所示的f3,序列如seq id no:13所示的b3,序列如seq id no:14所示的fip,序列如seq id no:15所示的bip,序列如seq id no:16所示的lf,序列如seq id no:17所示的lb;
9、utr4引物组包括序列如seq id no:18所示的f3,序列如seq id no:19所示的b3,序列如seq id no:20所示的fip,序列如seq id no:21所示的bip,序列如seq id no:22所示的lf,序列如seq id no:23所示的lb;
10、ns5引物组包括序列如seq id no:24所示的f3,序列如seq id no:25所示的b3,序列如seq id no:26所示的fip,序列如seq id no:27所示的bip,序列如seq id no:28所示的lf,序列如seq id no:29所示的lb。
11、其中,utr1引物组、utr2引物组、utr3引物组、utr4引物组和ns5引物组中各引物序列由下表1所示:
12、表1
13、
14、
15、进一步地,所述utr1引物组、utr2引物组、utr3引物组、utr4引物组和ns5引物组中的lf或lb序列,其5’端修饰有荧光淬灭基团,3’端修饰有荧光报告基团。
16、进一步地,所述荧光报告基团选自6-羧基荧光素、六氯-6-甲基荧光素、vic荧光染料、四氯-6-羧基荧光素、羧基-x-罗丹明、6-羧基四甲基罗丹明、2,7-二甲基-4,5-二氯-6-羧基荧光素、磺酰罗丹明、6-羧基-4’,5-二氯-2’,7’-二甲氧基荧光素琥珀酰亚胺酯、花菁3、花菁5或花菁5.5中的至少一种。
17、进一步地,所述荧光淬灭基团为bhq1、bhq2、bhq3中的至少一种。
18、进一步地,所述恒温扩增体系包括10×恒温扩增缓冲液、dna聚合酶、mgcl2、dntp、无核酸酶水。
19、进一步地,所述dna聚合酶为bst聚合酶。
20、进一步地,其使用方法具体包括以下步骤:
21、s1、采集待检测的样本;
22、s2、将采集的样本加入样本处理液中,提取病毒核酸;
23、s3、将提取的病毒核酸加入用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒中,置于恒温器中,在恒定温度下进行lamp扩增;
24、s4、扩增结束后,检测扩增产物,判断样本中是否存在hpgv-1病毒。
25、进一步地,s3步骤中,lamp扩增反应温度为50-65℃,反应时间为10-60分钟。
26、本发明的有益效果:
27、本发明技术方案中,建立的lamp方法相对于常规的荧光定量pcr等hpgv-1病毒检测方法更快速、高效,从提取样品到结果判定可在40分钟内完成,反应结果判定方法简单。本发明技术方案中,所用引物能达到每微升1拷贝的灵敏度,10copies/反应以上浓度可稳定检出,显著高于现有技术水平;本发明的引物能特异性检测hpgv-1病毒,实现了对目标病原体的无误识别与高效检测。在严格的实验条件下,该方法展现出了对hbv(乙型肝炎病毒)、hcv(丙型肝炎病毒)、hav(甲型肝炎病毒)、hev(戊型肝炎病毒)、hiv(人类免疫缺陷病毒)以及cmv(巨细胞病毒)等多种常见病原体的完全非反应性,确保了检测结果的纯净与准确性,有效避免了因交叉污染或误判而导致的临床误诊风险。
1.一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,包括以下组分:反应液、样本处理液、hpgv-1病毒阴性对照和hpgv-1病毒阳性对照;
2.根据权利要求1所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,所述引物组为utr1引物组、utr2引物组、utr3引物组、utr4引物组和ns5引物组中的至少一种。
3.根据权利要求2中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,所述utr1引物组包括序列如seq id no:1所示的f3,序列如seq id no:2所示的b3,序列如seqid no:3所示的fip,序列如seq id no:4所示的bip,序列如seq id no:5所示的lb;
4.根据权利要求3中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,所述utr1引物组、utr2引物组、utr3引物组、utr4引物组和ns5引物组中的lf或lb序列,其5’端修饰有荧光淬灭基团,3’端修饰有荧光报告基团。
5.根据权利要求4中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,所述荧光报告基团选自6-羧基荧光素、六氯-6-甲基荧光素、vic荧光染料、四氯-6-羧基荧光素、羧基-x-罗丹明、6-羧基四甲基罗丹明、2,7-二甲基-4,5-二氯-6-羧基荧光素、磺酰罗丹明、6-羧基-4’,5-二氯-2’,7’-二甲氧基荧光素琥珀酰亚胺酯、花菁3、花菁5或花菁5 .5中的至少一种。
6.根据权利要求4中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,所述荧光淬灭基团为bhq1、bhq2、bhq3中的至少一种。
7.根据权利要求1中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,所述恒温扩增体系包括10×恒温扩增缓冲液、dna聚合酶、mgcl2、dntp、无核酸酶水。
8.根据权利要求7中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,所述dna聚合酶为bst聚合酶。
9.根据权利要求1中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,其使用方法具体包括以下步骤:
10.根据权利要求9中所述的一种用于hpgv-1病毒lamp检测的试剂盒,其特征在于,s3步骤中,lamp扩增反应温度为50-65℃,反应时间为10-60分钟。
